1、提供或活化养分功能：生物固氮。

      可以将空气中的气态氮转化为可供作物吸收利用的的铵态氮,并在生长繁殖的过程中分泌多种微生物物质和多种生长素，可被植物直接吸收利用 

      2、提供或活化养分功能：溶磷

      它可以产生各类有机酸和无机酸，降低环境中的PH值，使难溶性磷酸盐降解为有效磷，能够被植物吸收利用。
      微生物解磷或溶磷机理是：通过产有机酸（如乳酸、柠檬酸）和一些酶类（如植酸酶），使土壤中的难溶性磷素如磷酸铁、磷酸铝以及有机磷酸盐矿化形成作物能够吸收利用的可溶性磷。

      3、提供或活化养分功能：解钾

      解钾常用的是胶冻(质)样类芽胞杆菌、环状芽胞杆菌，它可以将难溶性钾转化为有效钾，提高土壤可溶性钾的含量。

      4、提供或活化养分功能：溶解中量元素
      溶解土壤中难溶性钙、镁、硫等元素的活化，提供给作物利用
      微生物种类：氧化硫硫杆菌，根霉菌等

      5、提高化肥利用率，减少化肥的使用量
      生物有机肥料与化肥配合使用，可提高化肥的利用率，减少化肥的流失，从而降低化肥的施用量（10%--30%）。
      巴西、阿根廷种植大豆不施化学氮肥，美国仅施5Kg/公顷氮肥。我国则施用150Kg/公顷氮肥，产量比国外低30％以上。

      6、产生促进作物生长活性物质能力
      菌种主要有枯草芽胞杆菌、巨大芽胞杆菌、多粘类芽胞杆菌
      微生物的繁殖过程中，能分泌与合成多种有机酸、酶、植物生长素和促生长因子，使促生作用、肥效作用更好地结合起来，以提高和加强肥料效果。                                           

      7、促进土壤中有机物料腐熟功能，提高土壤有机质含量

      细菌：枯草芽孢杆菌、多粘芽孢杆菌、嗜热脂肪地芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等
      放线菌：白色链霉菌、天青链霉菌、白浅灰链霉菌、热紫链霉菌、唐德链霉菌、细黄链霉菌、灰螺链霉菌等。
      霉菌：黑曲霉、米曲霉、嗜热性侧孢霉、米根霉、卷枝毛霉等。
      酵母菌：粉状毕赤酵母、酿酒酵母、热带假丝酵母、扣囊拟内孢霉、乳酸可鲁维酵母。
      上述微生物菌在土壤中繁殖过程，需要消耗土壤中有机物料，转化为供植物吸收的营养物质和有机质。

      8、改善农产品品质功能
      微生物功能的繁殖，可降低土壤中硝酸盐物质的产生，降低农产品中的硝酸盐含量。
      增加农产品的平均含糖量
      增加维生素含量

      9、改良和修复土壤功能农药等污染物的生物修复作用
      生物修复在美国已经形成了一门新兴的生物技术产业，有几十家生物修复公司，专门提供污染环境生物修复的技术方案和产品，在美国生物修复市场的营业额已经达到了百亿美元（新兴的生物技术产业）。
      农药污染是中国所面临的迫切需要解决的问题，国内在农药残留的微生物降解方面进行了很多的研究，逐步在加大应用（现实迫切需要）。